Для проверки соответствия ключа сертификату достаточно выполнить команды (подставив имена файлов ключа и сертификата):
openssl rsa -noout -modulus -in PRIVATEKEY.key | openssl md5 openssl x509 -noout -modulus -in CERTIFICATE.crt | openssl md5
Обе команды должны отдавать одинаковую хеш-сумму.